Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HES2Q9Y543 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HES2Q9Y543 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms