Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TMED7Q9Y3B3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TMED7Q9Y3B3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms