Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZDHHC9Q9Y397 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms