Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED16Q9Y2X0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
MED16Q9Y2X0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED16Q9Y2X0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED16Q9Y2X0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MED16Q9Y2X0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms