Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YBX2Q9Y2T7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX2Q9Y2T7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms