Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP20Q9Y2K6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
USP20Q9Y2K6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms