Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FARSAQ9Y285 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FARSAQ9Y285 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.2 ms