Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HPSEQ9Y251 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
HPSEQ9Y251 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HPSEQ9Y251 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms