Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
NEU3Q9UQ49 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEU3Q9UQ49 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms