Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FZD1Q9UP38 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FZD1Q9UP38 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FZD1Q9UP38 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms