Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW0

TPX2, Targeting protein for Xklp2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPX2Q9ULW0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TPX2Q9ULW0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TPX2Q9ULW0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms