Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MED23Q9ULK4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MED23Q9ULK4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MED23Q9ULK4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms