Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ZNF608Q9ULD9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.38
ZNF608Q9ULD9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ZNF608Q9ULD9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms