Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF3C4Q9UKN8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms