Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
USP21Q9UK80 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
USP21Q9UK80 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
USP21Q9UK80 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms