Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC23Q9UJX2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC23Q9UJX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms