Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CDH22Q9UJ99 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH22Q9UJ99 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms