Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SMPXQ9UHP9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SMPXQ9UHP9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms