Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
OPN4Q9UHM6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
OPN4Q9UHM6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms