Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF2IRD1Q9UHL9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms