Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK1NQ9UHG2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK1NQ9UHG2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms