Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO40Q9UH90 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms