Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MTRF1LQ9UGC7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MTRF1LQ9UGC7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms