Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLN8Q9UBY8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CLN8Q9UBY8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms