Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FAM8A1Q9UBU6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM8A1Q9UBU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms