Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DKK3Q9UBP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DKK3Q9UBP4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms