Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MGAT4CQ9UBM8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MGAT4CQ9UBM8 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms