Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MARCH4Q9P2E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH4Q9P2E8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms