Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.51■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CHPF2Q9P2E5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHPF2Q9P2E5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms