Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HCN3Q9P1Z3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms