Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPG21Q9NZD8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPG21Q9NZD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms