Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A4Q9NY91 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC5A4Q9NY91 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms