Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MS4A12Q9NXJ0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MS4A12Q9NXJ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms