Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COMMD8Q9NX08 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
COMMD8Q9NX08 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
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