Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FBXO28Q9NVF7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO28Q9NVF7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms