Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NDFIP2Q9NV92 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NDFIP2Q9NV92 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NDFIP2Q9NV92 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms