Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
IMP3Q9NV31 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
IMP3Q9NV31 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms