Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LMBRD1Q9NUN5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LMBRD1Q9NUN5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMBRD1Q9NUN5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms