Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
DEPPQ9NTK1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DEPPQ9NTK1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms