Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOMER3Q9NSC5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms