Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GKN1Q9NS71 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GKN1Q9NS71 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms