Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LTBP3Q9NS15 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LTBP3Q9NS15 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LTBP3Q9NS15 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms