Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
C8orf4Q9NR00 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C8orf4Q9NR00 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms