Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
INCENPQ9NQS7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
INCENPQ9NQS7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms