Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NLRC4Q9NPP4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NLRC4Q9NPP4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NLRC4Q9NPP4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms