Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC4Q9NPG8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZDHHC4Q9NPG8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms