Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG4

PCDH12, Protocadherin-12, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH12Q9NPG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PCDH12Q9NPG4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PCDH12Q9NPG4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms