Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CABP2Q9NPB3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CABP2Q9NPB3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CABP2Q9NPB3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms