Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRMS1Q9HCU9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRMS1Q9HCU9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms