Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KIAA1549Q9HCM3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms